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原型株+Delta + Omicron 等變異株廣譜亞單位新冠疫苗下游工藝解決方案

2022-09-03 13:23:41

重組亞單位新冠疫苗

新冠病毒(SARS-CoV-2 )包含S蛋白 (spike protein),N蛋白(nucleocapsid protein),E 蛋白(envelope protein)和M 蛋白(membrane protein)四種結構蛋白(如圖1)1。其中S蛋白負責病毒識別宿主細胞受體并介導病毒與宿主細胞膜的融合,是病毒打開宿主細胞“大門”的“鑰匙”,也是病毒感染后引起宿主免疫系統產生中和性抗體的主要靶標,因此S蛋白在新冠疫苗開發中備受關注。新冠基因工程重組亞單位疫苗,是通過基因工程的方法,在體外制備新冠S蛋白(刺突糖蛋白)或者S蛋白片段制備而成的疫苗,所以新冠基因工程重組蛋白疫苗也有多種技術路線。

中國生物研究院基于自主建立的計算結構疫苗學技術平臺,在第 一 代重組新冠疫苗(NVSI-06-07)的基礎上,通過對流行株突變位點的進化規律和免疫逃逸能力進行計算分析,設計研發的第二代廣譜新冠疫苗(突變集成三聚化RBD)。

亞單位新冠疫苗制備工藝

1.基因序列設計:在體外制備新冠S蛋白(刺突糖蛋白)或者S蛋白片段制備而成的疫苗,目前選取RBD片段做抗原基因被廣泛使用于疫苗的開發,序列設計時將RBD串聯起來以重組表達同型二聚體及三聚體,在基因序列設計時加入His-tag序列或者Fc片段,通常加在C端,蛋白表達后切除His-tag或Fc對蛋白的性質沒有影響,若加在N端,切除后對蛋白的性質可能會造成一定的影響,同時加入His-tag或Fc序列也要考慮酶切位點序列。

2.克隆:將構建好的基因轉讓至CHO或者Bac-to-Bac表達系統中。

3.細胞培養:略

4.固液分離:離心去除細胞等固形物。

5.澄清:CHO或Bac-to-Bac表達系統表達的RBD及RBD二聚體及三聚體均分泌在細胞培養液中,離心后的上清液用深層過濾等微濾膜組件澄清處理。

6.純化:

6.1.RBD單體純化:澄清后的抗原原液根據克隆時帶的標簽,用Ni Seplife FF(TED)-His標簽,rProtein A Seplife Suno-Fc標簽進行快速捕獲,去除大量的HCP等雜質,減少體積;親和層析后再經凝膠過濾層析Seplife S-100中度純化去除聚集體及片段,后再經離子交換層析Q Large Scale 去除痕量的HCP及內毒素。此過程中要注意緩沖液及鹽濃度對過程的影響,必要的情況下要進行超濾伴隨洗濾的方式或者用凝膠過濾層析Seplife G-25 M進行緩沖液置換,同時要注意緩沖液對RBD收率及穩定性的影響,可以嘗試添加一些添加劑如甘油,精氨酸等來提高RBD的穩定性,減少沉淀及聚集體的產生。

6.2.RBD二聚體純化:捕獲階段同RBD單體捕獲,根據所帶標簽選擇對應的親和層析;捕獲的RBD二聚體去除多聚體及片段時選用Seplife S-200凝膠過濾填料純化,此工序也可嘗試用多模式層析MA Large Sacle 采用pH伴隨鹽雙梯度洗脫模式進行分離,分離后根據結果再用離子交換層析去除痕量的HCP及內毒素。

6.3RBD三聚體純化:同RBD二聚體純化。

7.調整抗原蛋白濃度及置換緩沖液:用超濾伴隨洗濾的方式調整抗原蛋白濃度及置換緩沖液。

8.除菌過濾:用0.22um的濾芯除菌過濾。

9.制劑化(略)。

第二代重組亞單位新冠疫苗:在原型株+Delta + Omicron 等變異株,及對流行株突變位點的進化規律和免疫逃逸能力的基礎上,進行RBD序列優化設計開發,同樣有RBD單體,RBD二聚體,RBD三聚體等多種設計路線,下游工藝同原型株株RBD亞單位疫苗下游工藝整體思路。

參考資料

1、Cryo-EM structure of the2019-nCoV spike in the prefusion conformation

2、An Y., Li S., Jin X, et al.A tandem-repeat dimeric RBD protein-based COVID-19 vaccine ZF2001 protects miceand nonhuman primates. bioRxiv 2021.03.11.434928;

3、專利號:CN201511021538.8(一種基于二聚化的受體結合區亞單位冠狀病毒疫苗)

4、Tectonic conformational changesof a coronavirus spike glycoprotein promote membrane fusion

5、Structure-based design ofprefusion-stabilized SARS-CoV-2 spikes

6、Ma X, Zou F, YuF, et al. NanoparticleVaccines Based on the Receptor Binding Domain(RBD) and Heptad Repeat (HR) ofSARS-CoV-2 Elicit Robust Protective Immune Responses. Immunity. 2020 Dec15;53(6)


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